Os fungicidas são classificados de acordo com a forma como são usados

1. Agente protetor
Antes que os microorganismos patogênicos entrem em contato com a planta ou imerjam a planta, a planta ou o ambiente circundante é tratado com um medicamento para inibir a germinação dos esporos patogênicos ou matar os esporos patogênicos germinados para proteger a planta de seus danos. Este efeito é chamado de efeito de proteção. Agentes com este efeito são agentes protetores. Como a mistura bordalesa, zinco zinco, sulfato de cobre, leite verde cobre, mancozeb, clorotalonil e assim por diante.
2. Agentes terapêuticos
Os microorganismos patogênicos do agente terapêutico se infiltraram na planta, mas a planta apresenta sintomas e está em período de incubação. A droga penetra no tecido da planta a partir da epiderme da planta e mata ou inibe o patógeno por transdução, difusão ou produção de metabólitos, de modo que a planta doente não sofra mais e restaure a saúde. Os agentes que têm esse efeito terapêutico são chamados de agentes terapêuticos ou quimioterápicos. Tais como tiofanato-metil, carbendazim, kasugamycin e assim por diante.
3. Agente de erradicação
Os erradicantes referem-se a patógenos que podem matar diretamente os patógenos que invadiram as plantas quando aplicados após a infecção das plantas. Agentes com tal efeito de erradicação são agentes de erradicação. Tais como thiram, pentaclorofenato de sódio, enxofre de cal e assim por diante.